Ada beberapa fator yang menjadi penyebab gagalnya seseorang dalam mencoba sistem hidroponik. Secara umum di sebabkan karena mendapat sumber informasi yang kurang tepat/ keliru sehingga terjadi kegagalan panen.
Adapun kesalahannya adalah menbagaikan hal-hal berikut :
- Pentingnya sinar matahari
- Kualitas air baku
- Faktor PH
- Desian sistem yang benar
- Cara semai yang benar
- Waktu pindah tanam